"L'Incident de Roswell" renvoie à un événement censé s'être produit en juillet 1947, et lors duquel les AAF auraient récupéré les restes d'un "disque volant" s'étant écrasé près de Roswell, au Nouveau-Mexique. En février 1994, le GAO, à la demande d'un parlementaire du Nouveau-Mexique, entreprit une opération d'audit afin de trouver les récits d'un tel incident et de déterminer si les récits le concernant avaient été correctement établis. Bien que l'effort du GAO dêt porter sur de nombreuses agences gouvernementales, il sembla se concentrer sur l'Air Force. Le SAF/AAZ, en tant que Point Central de Contact concernant ce problème, effectua une recherche systématique au sein des bureaux actuels de l'Air Force comme au sein de nombreux centres d'archives et de comptabilité qui auraient pu aider à expliquer cette affaire. Les recherches révélèrent que "l'Incident de Roswell" n'avait même pas été considéré comme un événement ovni jusqu'à la période de 1978 à 1980. L'incident avait été classé auparavant, l'AAF ayant initialement identifié les débris récupérés comme provenant d'un ballon méteo. Divers auteurs écrivirent, suite à cela, un certain nombre d'ouvrages déclarant que, non seulement que les débris en question provenaient d'un vaisseau spatial extraterrestre, mais que furent également retrouvés les corps extraterrestres des occupants de l'appareil. Ces déclarations continuent d'évoluer et l'Air Force est aujourd'hui régulièrement accusée de mettre en œuvre une "dissimulation" de cet événément supposé.
Les recherches ne débouchèrent sur aucune archive dans aucun bureau de l'Air Force existant qui puisse indiquer une "dissimulation" de l'USAF ou tout indice d'une telle dissimulation. Les efforts furent en conséquence intensifiés par les chercheurs de l'Air Force en divers lieux où les archives de cette période étaient stockés. Les récits examinés ne révélèrent aucun accroissement des opérations, de la sécurité, ou de toute autre activité en juillet 1947, qui aurait pu indiquer qu'un tel événement inhabituel ait pu avoir lieu. Des rapports furent trouvés et examinés en détail à propos d'un projet de ballon alors TRES SECRET, conçu pour surveiller les tests nucléaires soviétiques, connu sous le nom de projet Mogul. Diverses personnes survivantes ayant alors fait partie du projet furent retrouvées et interrogées, tout comme le fut la dernière personne vivante ayant participé à la récupération des débris sur le site d'origine de Roswell en juillet 1947, ainsi que l'ancien officier qui identifia tout d'abord l'épave comme celle d'un ballon. Le recoupage de l'ensemble des informations déduites ou obtenues indiqua que le matériau récupéré près de Roswell avait la consistance d'un appareillage de ballon et plus particulièrement d'un des ballons Mogul n'ayant pas été récupéré. Les efforts de recherche de l'Air Force ne révélèrent aucun récit concernant la récupération de quelconques corps "extraterrestres" ou matériau extraterrestre.